甜菜苗腐病在温暖多湿的年份和季节易发病，尤其是大雨过后发病较列;生产田地势低洼、积水、湿气滞留、栽植过密、偏施过施氮肥发病重。移苗栽植较直播的易发病，在湿度大的夜晚，不足1cm小病斑可在一夜之内使大部分叶片变软腐烂，有的布满白色菌丝。
1)实行分次间苗和晚定苗，以保证定留壮苗。
2)及时发现并拔除病株，集中田外深埋或烧毁，病穴应马上撒些生石灰灭菌。
3)适时适量浇水，浇水时间安排在上午进行，严防大水漫灌，雨后及时排水，以降低土壤和株间湿度。
4)选用耐高温多雨品种。
5)施用酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥，避免肥料带菌传播病害。
6)选留种子要充分成熟，以利苗壮。
